Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E4

Cysrt1, Cysteine-rich tail protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cysrt1Q9D1E4 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cysrt1Q9D1E4 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cysrt1Q9D1E4 4930447F04Rik-201ENSMUST00000033525 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cysrt1Q9D1E4 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cysrt1Q9D1E4 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cysrt1Q9D1E4 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cysrt1Q9D1E4 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cysrt1Q9D1E4 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cysrt1Q9D1E4 Gm5458-201ENSMUST00000096121 997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cysrt1Q9D1E4 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cysrt1Q9D1E4 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cysrt1Q9D1E4 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cysrt1Q9D1E4 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cysrt1Q9D1E4 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cysrt1Q9D1E4 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cysrt1Q9D1E4 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cysrt1Q9D1E4 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cysrt1Q9D1E4 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cysrt1Q9D1E4 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cysrt1Q9D1E4 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cysrt1Q9D1E4 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cysrt1Q9D1E4 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cysrt1Q9D1E4 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cysrt1Q9D1E4 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cysrt1Q9D1E4 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cysrt1Q9D1E4 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cysrt1Q9D1E4 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cysrt1Q9D1E4 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cysrt1Q9D1E4 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cysrt1Q9D1E4 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cysrt1Q9D1E4 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cysrt1Q9D1E4 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cysrt1Q9D1E4 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cysrt1Q9D1E4 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cysrt1Q9D1E4 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cysrt1Q9D1E4 4930579H20Rik-201ENSMUST00000187815 1516 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cysrt1Q9D1E4 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cysrt1Q9D1E4 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cysrt1Q9D1E4 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cysrt1Q9D1E4 Zfp942-201ENSMUST00000074295 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cysrt1Q9D1E4 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cysrt1Q9D1E4 Gm18719-201ENSMUST00000196696 1413 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cysrt1Q9D1E4 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cysrt1Q9D1E4 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cysrt1Q9D1E4 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cysrt1Q9D1E4 Gm23604-201ENSMUST00000104311 132 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cysrt1Q9D1E4 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cysrt1Q9D1E4 Nptn-202ENSMUST00000114121 863 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cysrt1Q9D1E4 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cysrt1Q9D1E4 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cysrt1Q9D1E4 Gm12001-201ENSMUST00000121727 913 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cysrt1Q9D1E4 Gm15529-201ENSMUST00000121833 994 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cysrt1Q9D1E4 Gm12031-201ENSMUST00000156150 627 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cysrt1Q9D1E4 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cysrt1Q9D1E4 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cysrt1Q9D1E4 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cysrt1Q9D1E4 Vmn1r-ps23-201ENSMUST00000175708 295 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cysrt1Q9D1E4 Cdhr4-208ENSMUST00000176373 492 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cysrt1Q9D1E4 Gm26272-201ENSMUST00000179241 132 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cysrt1Q9D1E4 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cysrt1Q9D1E4 Gm26907-201ENSMUST00000181794 729 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cysrt1Q9D1E4 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cysrt1Q9D1E4 Gm37257-201ENSMUST00000194871 717 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cysrt1Q9D1E4 9430092D12Rik-201ENSMUST00000194937 1274 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cysrt1Q9D1E4 Tmprss11c-202ENSMUST00000196462 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cysrt1Q9D1E4 Gm8234-201ENSMUST00000198523 1107 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cysrt1Q9D1E4 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cysrt1Q9D1E4 Kcne3-206ENSMUST00000207995 439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cysrt1Q9D1E4 Gm36371-201ENSMUST00000209043 1103 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cysrt1Q9D1E4 AU017674-201ENSMUST00000222864 720 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cysrt1Q9D1E4 Gngt1-201ENSMUST00000031673 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cysrt1Q9D1E4 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cysrt1Q9D1E4 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cysrt1Q9D1E4 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cysrt1Q9D1E4 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cysrt1Q9D1E4 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cysrt1Q9D1E4 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cysrt1Q9D1E4 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cysrt1Q9D1E4 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cysrt1Q9D1E4 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cysrt1Q9D1E4 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cysrt1Q9D1E4 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cysrt1Q9D1E4 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cysrt1Q9D1E4 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cysrt1Q9D1E4 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cysrt1Q9D1E4 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cysrt1Q9D1E4 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cysrt1Q9D1E4 Matr3-216ENSMUST00000190653 1846 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cysrt1Q9D1E4 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cysrt1Q9D1E4 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cysrt1Q9D1E4 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cysrt1Q9D1E4 Cd59a-201ENSMUST00000040423 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cysrt1Q9D1E4 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cysrt1Q9D1E4 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cysrt1Q9D1E4 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cysrt1Q9D1E4 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cysrt1Q9D1E4 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cysrt1Q9D1E4 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cysrt1Q9D1E4 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cysrt1Q9D1E4 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms