Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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