Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gtf2e1Q9D0D5 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms