Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms