Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Utp23Q9CX11 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 556.8 ms