Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Commd4Q9CQ02 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Commd4Q9CQ02 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Commd4Q9CQ02 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Commd4Q9CQ02 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Commd4Q9CQ02 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Commd4Q9CQ02 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Commd4Q9CQ02 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Commd4Q9CQ02 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Commd4Q9CQ02 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Commd4Q9CQ02 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Commd4Q9CQ02 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Commd4Q9CQ02 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Commd4Q9CQ02 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Commd4Q9CQ02 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Commd4Q9CQ02 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Commd4Q9CQ02 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Commd4Q9CQ02 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Commd4Q9CQ02 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Commd4Q9CQ02 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Commd4Q9CQ02 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Commd4Q9CQ02 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Commd4Q9CQ02 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Commd4Q9CQ02 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Commd4Q9CQ02 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Commd4Q9CQ02 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Commd4Q9CQ02 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Commd4Q9CQ02 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Commd4Q9CQ02 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Commd4Q9CQ02 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Commd4Q9CQ02 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Commd4Q9CQ02 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Commd4Q9CQ02 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Commd4Q9CQ02 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Commd4Q9CQ02 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Commd4Q9CQ02 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Commd4Q9CQ02 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Commd4Q9CQ02 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Commd4Q9CQ02 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Commd4Q9CQ02 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Commd4Q9CQ02 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Commd4Q9CQ02 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Commd4Q9CQ02 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Commd4Q9CQ02 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Commd4Q9CQ02 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Commd4Q9CQ02 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Commd4Q9CQ02 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Commd4Q9CQ02 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Commd4Q9CQ02 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Commd4Q9CQ02 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Commd4Q9CQ02 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Commd4Q9CQ02 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Commd4Q9CQ02 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Commd4Q9CQ02 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Commd4Q9CQ02 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Commd4Q9CQ02 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Commd4Q9CQ02 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Commd4Q9CQ02 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Commd4Q9CQ02 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Commd4Q9CQ02 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Commd4Q9CQ02 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Commd4Q9CQ02 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Commd4Q9CQ02 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Commd4Q9CQ02 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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Commd4Q9CQ02 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Commd4Q9CQ02 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Commd4Q9CQ02 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
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Commd4Q9CQ02 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Commd4Q9CQ02 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Commd4Q9CQ02 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Commd4Q9CQ02 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Commd4Q9CQ02 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Commd4Q9CQ02 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Commd4Q9CQ02 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Commd4Q9CQ02 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Commd4Q9CQ02 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Commd4Q9CQ02 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Commd4Q9CQ02 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Commd4Q9CQ02 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Commd4Q9CQ02 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Commd4Q9CQ02 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Commd4Q9CQ02 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Commd4Q9CQ02 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Commd4Q9CQ02 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Commd4Q9CQ02 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Commd4Q9CQ02 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Commd4Q9CQ02 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Commd4Q9CQ02 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Commd4Q9CQ02 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Commd4Q9CQ02 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Commd4Q9CQ02 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms