Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Rpl17Q9CPR4 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Rpl17Q9CPR4 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Rpl17Q9CPR4 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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