Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Olfr314-201ENSMUST00000076393 1131 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Hdac9Q99N13 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Hdac9Q99N13 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Hdac9Q99N13 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Hdac9Q99N13 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Hdac9Q99N13 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Hdac9Q99N13 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Hdac9Q99N13 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Hdac9Q99N13 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.5 ms