Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tdrd1Q99MV1 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tdrd1Q99MV1 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tdrd1Q99MV1 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tdrd1Q99MV1 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tdrd1Q99MV1 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tdrd1Q99MV1 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tdrd1Q99MV1 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tdrd1Q99MV1 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tdrd1Q99MV1 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tdrd1Q99MV1 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tdrd1Q99MV1 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tdrd1Q99MV1 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tdrd1Q99MV1 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tdrd1Q99MV1 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tdrd1Q99MV1 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tdrd1Q99MV1 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tdrd1Q99MV1 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tdrd1Q99MV1 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tdrd1Q99MV1 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tdrd1Q99MV1 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tdrd1Q99MV1 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tdrd1Q99MV1 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tdrd1Q99MV1 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tdrd1Q99MV1 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tdrd1Q99MV1 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tdrd1Q99MV1 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tdrd1Q99MV1 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tdrd1Q99MV1 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tdrd1Q99MV1 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tdrd1Q99MV1 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tdrd1Q99MV1 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tdrd1Q99MV1 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tdrd1Q99MV1 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tdrd1Q99MV1 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tdrd1Q99MV1 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tdrd1Q99MV1 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tdrd1Q99MV1 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tdrd1Q99MV1 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tdrd1Q99MV1 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tdrd1Q99MV1 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tdrd1Q99MV1 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tdrd1Q99MV1 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tdrd1Q99MV1 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tdrd1Q99MV1 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tdrd1Q99MV1 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tdrd1Q99MV1 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tdrd1Q99MV1 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tdrd1Q99MV1 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tdrd1Q99MV1 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Tdrd1Q99MV1 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Tdrd1Q99MV1 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Tdrd1Q99MV1 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Tdrd1Q99MV1 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tdrd1Q99MV1 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tdrd1Q99MV1 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tdrd1Q99MV1 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Tdrd1Q99MV1 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tdrd1Q99MV1 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Tdrd1Q99MV1 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tdrd1Q99MV1 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Tdrd1Q99MV1 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tdrd1Q99MV1 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tdrd1Q99MV1 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tdrd1Q99MV1 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Tdrd1Q99MV1 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
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Tdrd1Q99MV1 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tdrd1Q99MV1 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tdrd1Q99MV1 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tdrd1Q99MV1 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tdrd1Q99MV1 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tdrd1Q99MV1 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tdrd1Q99MV1 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tdrd1Q99MV1 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tdrd1Q99MV1 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tdrd1Q99MV1 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tdrd1Q99MV1 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tdrd1Q99MV1 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tdrd1Q99MV1 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tdrd1Q99MV1 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tdrd1Q99MV1 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tdrd1Q99MV1 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tdrd1Q99MV1 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tdrd1Q99MV1 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tdrd1Q99MV1 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79 ms