Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Tcl1b4-202ENSMUST00000222867 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Mrps33-202ENSMUST00000114797 500 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Gm14630-201ENSMUST00000118057 246 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Plxna4os3-201ENSMUST00000127668 269 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Gm15341-201ENSMUST00000137315 592 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Gm12207-201ENSMUST00000143016 494 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Gm15221-201ENSMUST00000144439 414 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Gm26532-201ENSMUST00000180630 690 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Ighv1-8-201ENSMUST00000192236 293 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Srp14-201ENSMUST00000009693 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Rgs8-205ENSMUST00000111815 765 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Gm12047-201ENSMUST00000117561 944 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Ccpg1os-201ENSMUST00000124565 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 4930529I22Rik-201ENSMUST00000131509 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Naa38-204ENSMUST00000144531 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Gm28845-201ENSMUST00000144760 733 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 2010204K13Rik-203ENSMUST00000150671 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Gm16184-201ENSMUST00000162324 573 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Gm6686-201ENSMUST00000178455 258 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Mir8104-201ENSMUST00000185165 101 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 4930486N12Rik-201ENSMUST00000206668 632 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 AC165249.1-203ENSMUST00000219976 392 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 CR974487.1-201ENSMUST00000220984 413 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 AC132881.1-201ENSMUST00000223780 1062 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Rce1-203ENSMUST00000224707 1255 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Olfr403-201ENSMUST00000076675 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Olfr43-201ENSMUST00000078936 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Zwilch-209ENSMUST00000176299 1831 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Ube2l3-203ENSMUST00000115700 571 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Supt20-ps-201ENSMUST00000117999 1560 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Gm12499-201ENSMUST00000121961 546 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Banf2os-201ENSMUST00000124061 771 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Stamos-201ENSMUST00000152524 801 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Gm38038-201ENSMUST00000193803 259 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Gm42952-204ENSMUST00000198572 408 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Fgfbp1-203ENSMUST00000199894 1228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Theg-201ENSMUST00000020566 1444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Olfr1248-201ENSMUST00000216129 1078 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Gm11437-201ENSMUST00000050771 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Atp5s-201ENSMUST00000021372 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Olfr434-203ENSMUST00000216562 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprtQ99M80 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms