Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 Ptgds-203ENSMUST00000114259 775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubxn2aQ99KJ0 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubxn2aQ99KJ0 Tex33-203ENSMUST00000169575 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubxn2aQ99KJ0 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubxn2aQ99KJ0 Gm26119-201ENSMUST00000175601 104 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubxn2aQ99KJ0 Marc1-203ENSMUST00000189492 1239 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubxn2aQ99KJ0 Gm37851-201ENSMUST00000193871 889 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubxn2aQ99KJ0 Gm37257-201ENSMUST00000194871 717 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubxn2aQ99KJ0 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubxn2aQ99KJ0 D5Ertd605e-201ENSMUST00000201128 1081 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubxn2aQ99KJ0 AC140409.3-201ENSMUST00000215601 358 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubxn2aQ99KJ0 Ctrl-201ENSMUST00000034368 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubxn2aQ99KJ0 Rps3a2-201ENSMUST00000074245 792 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubxn2aQ99KJ0 Rps3a3-201ENSMUST00000074680 795 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubxn2aQ99KJ0 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubxn2aQ99KJ0 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubxn2aQ99KJ0 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubxn2aQ99KJ0 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubxn2aQ99KJ0 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubxn2aQ99KJ0 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubxn2aQ99KJ0 Ptpn2-202ENSMUST00000120934 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubxn2aQ99KJ0 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubxn2aQ99KJ0 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ubxn2aQ99KJ0 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ubxn2aQ99KJ0 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Ces2f-203ENSMUST00000212926 1430 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn2aQ99KJ0 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Mrps36-203ENSMUST00000109333 701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Gm15815-201ENSMUST00000120569 255 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Gm4943-201ENSMUST00000132879 424 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Gm14798-201ENSMUST00000139695 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Hoxd3os1-203ENSMUST00000145799 511 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Auts2-216ENSMUST00000185450 144 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Gm28096-201ENSMUST00000191391 824 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn2aQ99KJ0 AC121567.1-201ENSMUST00000227213 842 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Psmc1-201ENSMUST00000021595 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Gm12912-201ENSMUST00000121596 1381 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Prss23os-202ENSMUST00000179361 1362 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Gm42970-201ENSMUST00000196407 1352 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubxn2aQ99KJ0 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubxn2aQ99KJ0 AC022682.1-201ENSMUST00000224624 2023 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubxn2aQ99KJ0 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Gm14113-201ENSMUST00000121399 976 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubxn2aQ99KJ0 4930524O07Rik-202ENSMUST00000162334 293 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms