Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ddb2Q99J79 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ddb2Q99J79 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ddb2Q99J79 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ddb2Q99J79 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ddb2Q99J79 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ddb2Q99J79 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ddb2Q99J79 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ddb2Q99J79 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ddb2Q99J79 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ddb2Q99J79 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ddb2Q99J79 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ddb2Q99J79 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ddb2Q99J79 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ddb2Q99J79 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ddb2Q99J79 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ddb2Q99J79 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ddb2Q99J79 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ddb2Q99J79 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ddb2Q99J79 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ddb2Q99J79 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ddb2Q99J79 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ddb2Q99J79 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ddb2Q99J79 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ddb2Q99J79 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ddb2Q99J79 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ddb2Q99J79 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ddb2Q99J79 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ddb2Q99J79 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ddb2Q99J79 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ddb2Q99J79 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ddb2Q99J79 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ddb2Q99J79 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ddb2Q99J79 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ddb2Q99J79 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ddb2Q99J79 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ddb2Q99J79 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ddb2Q99J79 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ddb2Q99J79 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ddb2Q99J79 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ddb2Q99J79 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ddb2Q99J79 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ddb2Q99J79 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ddb2Q99J79 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ddb2Q99J79 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ddb2Q99J79 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ddb2Q99J79 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ddb2Q99J79 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ddb2Q99J79 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ddb2Q99J79 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ddb2Q99J79 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ddb2Q99J79 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ddb2Q99J79 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ddb2Q99J79 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ddb2Q99J79 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ddb2Q99J79 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ddb2Q99J79 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ddb2Q99J79 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ddb2Q99J79 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ddb2Q99J79 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ddb2Q99J79 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ddb2Q99J79 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ddb2Q99J79 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ddb2Q99J79 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ddb2Q99J79 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ddb2Q99J79 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ddb2Q99J79 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ddb2Q99J79 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ddb2Q99J79 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ddb2Q99J79 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ddb2Q99J79 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ddb2Q99J79 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ddb2Q99J79 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ddb2Q99J79 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ddb2Q99J79 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ddb2Q99J79 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ddb2Q99J79 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ddb2Q99J79 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ddb2Q99J79 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ddb2Q99J79 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ddb2Q99J79 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ddb2Q99J79 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ddb2Q99J79 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ddb2Q99J79 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ddb2Q99J79 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ddb2Q99J79 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ddb2Q99J79 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ddb2Q99J79 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ddb2Q99J79 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ddb2Q99J79 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ddb2Q99J79 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ddb2Q99J79 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ddb2Q99J79 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ddb2Q99J79 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ddb2Q99J79 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ddb2Q99J79 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ddb2Q99J79 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ddb2Q99J79 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ddb2Q99J79 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ddb2Q99J79 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms