Protein–RNA interactions for Protein: Q920F6

Smc1b, Structural maintenance of chromosomes protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc1bQ920F6 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smc1bQ920F6 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smc1bQ920F6 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smc1bQ920F6 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smc1bQ920F6 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smc1bQ920F6 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Smc1bQ920F6 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smc1bQ920F6 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smc1bQ920F6 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smc1bQ920F6 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smc1bQ920F6 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smc1bQ920F6 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smc1bQ920F6 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smc1bQ920F6 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smc1bQ920F6 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smc1bQ920F6 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smc1bQ920F6 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smc1bQ920F6 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smc1bQ920F6 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smc1bQ920F6 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smc1bQ920F6 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smc1bQ920F6 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Smc1bQ920F6 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smc1bQ920F6 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Smc1bQ920F6 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Smc1bQ920F6 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Smc1bQ920F6 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smc1bQ920F6 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smc1bQ920F6 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smc1bQ920F6 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Smc1bQ920F6 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Smc1bQ920F6 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smc1bQ920F6 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smc1bQ920F6 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smc1bQ920F6 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smc1bQ920F6 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smc1bQ920F6 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Smc1bQ920F6 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smc1bQ920F6 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smc1bQ920F6 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smc1bQ920F6 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smc1bQ920F6 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smc1bQ920F6 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smc1bQ920F6 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smc1bQ920F6 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smc1bQ920F6 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smc1bQ920F6 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smc1bQ920F6 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smc1bQ920F6 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smc1bQ920F6 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smc1bQ920F6 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smc1bQ920F6 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smc1bQ920F6 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smc1bQ920F6 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smc1bQ920F6 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smc1bQ920F6 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smc1bQ920F6 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smc1bQ920F6 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smc1bQ920F6 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smc1bQ920F6 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smc1bQ920F6 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Smc1bQ920F6 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smc1bQ920F6 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smc1bQ920F6 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smc1bQ920F6 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smc1bQ920F6 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smc1bQ920F6 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smc1bQ920F6 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Smc1bQ920F6 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smc1bQ920F6 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smc1bQ920F6 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Smc1bQ920F6 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smc1bQ920F6 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Smc1bQ920F6 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smc1bQ920F6 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smc1bQ920F6 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smc1bQ920F6 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smc1bQ920F6 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smc1bQ920F6 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smc1bQ920F6 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smc1bQ920F6 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smc1bQ920F6 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smc1bQ920F6 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smc1bQ920F6 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smc1bQ920F6 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smc1bQ920F6 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smc1bQ920F6 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smc1bQ920F6 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smc1bQ920F6 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smc1bQ920F6 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smc1bQ920F6 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smc1bQ920F6 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smc1bQ920F6 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smc1bQ920F6 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smc1bQ920F6 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smc1bQ920F6 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smc1bQ920F6 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smc1bQ920F6 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smc1bQ920F6 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smc1bQ920F6 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms