Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE09

Ttc39c, Tetratricopeptide repeat protein 39C, mousemouse

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Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ttc39cQ8VE09 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Ttc39cQ8VE09 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Ttc39cQ8VE09 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ttc39cQ8VE09 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ttc39cQ8VE09 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ttc39cQ8VE09 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc39cQ8VE09 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc39cQ8VE09 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc39cQ8VE09 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc39cQ8VE09 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc39cQ8VE09 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc39cQ8VE09 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc39cQ8VE09 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc39cQ8VE09 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Ttc39cQ8VE09 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
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