Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD72

Ttc8, Tetratricopeptide repeat protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc8Q8VD72 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms