Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Defa-ps4-201ENSMUST00000118021 183 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Sox5os1-201ENSMUST00000156994 1585 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubxn4Q8VCH8 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms