Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms