Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trip10Q8CJ53 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trip10Q8CJ53 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trip10Q8CJ53 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trip10Q8CJ53 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trip10Q8CJ53 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Trip10Q8CJ53 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trip10Q8CJ53 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trip10Q8CJ53 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trip10Q8CJ53 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trip10Q8CJ53 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trip10Q8CJ53 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trip10Q8CJ53 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trip10Q8CJ53 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trip10Q8CJ53 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trip10Q8CJ53 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trip10Q8CJ53 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trip10Q8CJ53 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trip10Q8CJ53 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Trip10Q8CJ53 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Trip10Q8CJ53 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Trip10Q8CJ53 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Trip10Q8CJ53 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trip10Q8CJ53 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trip10Q8CJ53 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trip10Q8CJ53 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Trip10Q8CJ53 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trip10Q8CJ53 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Trip10Q8CJ53 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Trip10Q8CJ53 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Trip10Q8CJ53 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trip10Q8CJ53 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trip10Q8CJ53 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trip10Q8CJ53 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Trip10Q8CJ53 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trip10Q8CJ53 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Trip10Q8CJ53 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Trip10Q8CJ53 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trip10Q8CJ53 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trip10Q8CJ53 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trip10Q8CJ53 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trip10Q8CJ53 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trip10Q8CJ53 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Trip10Q8CJ53 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Trip10Q8CJ53 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trip10Q8CJ53 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trip10Q8CJ53 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trip10Q8CJ53 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trip10Q8CJ53 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Trip10Q8CJ53 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trip10Q8CJ53 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trip10Q8CJ53 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trip10Q8CJ53 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trip10Q8CJ53 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trip10Q8CJ53 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trip10Q8CJ53 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trip10Q8CJ53 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trip10Q8CJ53 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trip10Q8CJ53 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trip10Q8CJ53 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trip10Q8CJ53 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trip10Q8CJ53 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trip10Q8CJ53 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trip10Q8CJ53 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trip10Q8CJ53 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trip10Q8CJ53 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trip10Q8CJ53 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trip10Q8CJ53 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trip10Q8CJ53 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trip10Q8CJ53 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Trip10Q8CJ53 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trip10Q8CJ53 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trip10Q8CJ53 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Trip10Q8CJ53 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Trip10Q8CJ53 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Trip10Q8CJ53 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trip10Q8CJ53 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trip10Q8CJ53 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trip10Q8CJ53 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Trip10Q8CJ53 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Trip10Q8CJ53 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trip10Q8CJ53 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trip10Q8CJ53 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Trip10Q8CJ53 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trip10Q8CJ53 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Trip10Q8CJ53 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trip10Q8CJ53 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trip10Q8CJ53 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trip10Q8CJ53 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trip10Q8CJ53 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trip10Q8CJ53 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trip10Q8CJ53 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trip10Q8CJ53 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trip10Q8CJ53 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trip10Q8CJ53 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trip10Q8CJ53 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trip10Q8CJ53 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trip10Q8CJ53 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trip10Q8CJ53 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trip10Q8CJ53 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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