Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LgsnQ8CIX8 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LgsnQ8CIX8 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LgsnQ8CIX8 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LgsnQ8CIX8 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LgsnQ8CIX8 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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LgsnQ8CIX8 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LgsnQ8CIX8 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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LgsnQ8CIX8 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LgsnQ8CIX8 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LgsnQ8CIX8 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LgsnQ8CIX8 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LgsnQ8CIX8 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LgsnQ8CIX8 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LgsnQ8CIX8 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LgsnQ8CIX8 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
LgsnQ8CIX8 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LgsnQ8CIX8 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LgsnQ8CIX8 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LgsnQ8CIX8 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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LgsnQ8CIX8 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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LgsnQ8CIX8 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LgsnQ8CIX8 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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LgsnQ8CIX8 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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LgsnQ8CIX8 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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LgsnQ8CIX8 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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LgsnQ8CIX8 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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LgsnQ8CIX8 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LgsnQ8CIX8 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LgsnQ8CIX8 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LgsnQ8CIX8 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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LgsnQ8CIX8 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms