Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.7 ms