Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2S7

Amigo3, Amphoterin-induced protein 3, mousemouse

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Length 508 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo3Q8C2S7 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Amigo3Q8C2S7 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Amigo3Q8C2S7 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Amigo3Q8C2S7 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Amigo3Q8C2S7 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Amigo3Q8C2S7 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Amigo3Q8C2S7 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Amigo3Q8C2S7 Gm11544-201ENSMUST00000120215 382 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Amigo3Q8C2S7 7330404K18Rik-201ENSMUST00000125558 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Amigo3Q8C2S7 Atp5e-201ENSMUST00000016396 421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Amigo3Q8C2S7 1700018G05Rik-201ENSMUST00000211116 386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Amigo3Q8C2S7 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Amigo3Q8C2S7 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Amigo3Q8C2S7 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Amigo3Q8C2S7 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Amigo3Q8C2S7 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Amigo3Q8C2S7 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Amigo3Q8C2S7 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Amigo3Q8C2S7 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Amigo3Q8C2S7 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Amigo3Q8C2S7 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Amigo3Q8C2S7 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Amigo3Q8C2S7 Gm8725-201ENSMUST00000221829 1333 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Amigo3Q8C2S7 Gm15984-202ENSMUST00000156466 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Amigo3Q8C2S7 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Amigo3Q8C2S7 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Amigo3Q8C2S7 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Amigo3Q8C2S7 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Amigo3Q8C2S7 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Amigo3Q8C2S7 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Amigo3Q8C2S7 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Amigo3Q8C2S7 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Amigo3Q8C2S7 Igsf11-202ENSMUST00000114706 1578 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Amigo3Q8C2S7 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Amigo3Q8C2S7 Gm22661-201ENSMUST00000104192 132 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Amigo3Q8C2S7 Tnnt3-203ENSMUST00000105941 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Amigo3Q8C2S7 Tnnt3-204ENSMUST00000105942 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Amigo3Q8C2S7 Tnnt3-205ENSMUST00000105943 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Amigo3Q8C2S7 Tnnt3-207ENSMUST00000105945 747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Amigo3Q8C2S7 Tnnt3-208ENSMUST00000105946 765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Amigo3Q8C2S7 Gm14227-201ENSMUST00000119431 629 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Amigo3Q8C2S7 Gm14152-201ENSMUST00000127020 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Amigo3Q8C2S7 Gm3898-201ENSMUST00000180221 613 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Amigo3Q8C2S7 Gm29595-202ENSMUST00000187954 466 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Amigo3Q8C2S7 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Amigo3Q8C2S7 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Amigo3Q8C2S7 AC107711.3-201ENSMUST00000228939 1035 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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Amigo3Q8C2S7 Tdpoz4-201ENSMUST00000075953 1113 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Amigo3Q8C2S7 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Amigo3Q8C2S7 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Amigo3Q8C2S7 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Amigo3Q8C2S7 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Amigo3Q8C2S7 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Amigo3Q8C2S7 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Amigo3Q8C2S7 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Amigo3Q8C2S7 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Amigo3Q8C2S7 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Amigo3Q8C2S7 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Amigo3Q8C2S7 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Amigo3Q8C2S7 Gm30504-201ENSMUST00000209316 1688 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Amigo3Q8C2S7 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Amigo3Q8C2S7 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Amigo3Q8C2S7 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Amigo3Q8C2S7 2700099C18Rik-203ENSMUST00000182475 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Amigo3Q8C2S7 Fcer2a-205ENSMUST00000208145 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Amigo3Q8C2S7 AC163646.3-202ENSMUST00000228685 691 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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Amigo3Q8C2S7 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Amigo3Q8C2S7 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Amigo3Q8C2S7 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Amigo3Q8C2S7 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Amigo3Q8C2S7 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Amigo3Q8C2S7 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Amigo3Q8C2S7 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Amigo3Q8C2S7 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Amigo3Q8C2S7 Gm35963-201ENSMUST00000211762 1425 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Amigo3Q8C2S7 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Amigo3Q8C2S7 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Amigo3Q8C2S7 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Amigo3Q8C2S7 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Amigo3Q8C2S7 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Amigo3Q8C2S7 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Amigo3Q8C2S7 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Amigo3Q8C2S7 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Amigo3Q8C2S7 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Amigo3Q8C2S7 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Amigo3Q8C2S7 Dpm1-202ENSMUST00000109193 1076 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms