Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Hmgn2-201ENSMUST00000100472 881 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Rpsa-ps5-201ENSMUST00000121462 885 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Gm16538-201ENSMUST00000162407 442 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Gm24954-201ENSMUST00000178831 110 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Uqcrc2-201ENSMUST00000033176 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Gng5-ps-201ENSMUST00000120931 205 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Gm5267-201ENSMUST00000191574 1045 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Cfap61-201ENSMUST00000116398 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snx17Q8BVL3 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms