Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms