Protein–RNA interactions for Protein: Q80W37

Snupn, Snurportin-1, mousemouse

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Length 358 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnupnQ80W37 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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SnupnQ80W37 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
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SnupnQ80W37 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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SnupnQ80W37 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
SnupnQ80W37 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms