Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Ttc29Q80VM3 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Ttc29Q80VM3 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Ttc29Q80VM3 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Ttc29Q80VM3 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Ttc29Q80VM3 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Ttc29Q80VM3 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Ttc29Q80VM3 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ttc29Q80VM3 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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