Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Gm37806-201ENSMUST00000194524 6387 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Son-202ENSMUST00000114037 8399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Hivep2-204ENSMUST00000187083 9268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 5033428I22Rik-204ENSMUST00000210633 6652 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim12Q78RX3 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms