Protein–RNA interactions for Protein: Q78J03

Msrb2, Methionine-R-sulfoxide reductase B2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msrb2Q78J03 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Msrb2Q78J03 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Msrb2Q78J03 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Msrb2Q78J03 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Msrb2Q78J03 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Msrb2Q78J03 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Msrb2Q78J03 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Msrb2Q78J03 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Msrb2Q78J03 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Msrb2Q78J03 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Msrb2Q78J03 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Msrb2Q78J03 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Msrb2Q78J03 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Msrb2Q78J03 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Msrb2Q78J03 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Msrb2Q78J03 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Msrb2Q78J03 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Msrb2Q78J03 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Msrb2Q78J03 Gm23745-201ENSMUST00000104230 125 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Msrb2Q78J03 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Msrb2Q78J03 Gm11957-201ENSMUST00000118304 779 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Msrb2Q78J03 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Msrb2Q78J03 Gm14052-201ENSMUST00000121434 1031 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Msrb2Q78J03 Slfn5os-201ENSMUST00000127074 574 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Msrb2Q78J03 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Msrb2Q78J03 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Msrb2Q78J03 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Msrb2Q78J03 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Msrb2Q78J03 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Msrb2Q78J03 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Msrb2Q78J03 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Msrb2Q78J03 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Msrb2Q78J03 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Msrb2Q78J03 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Msrb2Q78J03 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Msrb2Q78J03 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Msrb2Q78J03 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Msrb2Q78J03 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Msrb2Q78J03 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Msrb2Q78J03 AC158388.3-202ENSMUST00000225517 775 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Msrb2Q78J03 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Msrb2Q78J03 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Msrb2Q78J03 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Msrb2Q78J03 Rpl3-201ENSMUST00000081650 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Msrb2Q78J03 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Msrb2Q78J03 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Msrb2Q78J03 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Msrb2Q78J03 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Msrb2Q78J03 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Msrb2Q78J03 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Msrb2Q78J03 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Msrb2Q78J03 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Msrb2Q78J03 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Msrb2Q78J03 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Msrb2Q78J03 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Msrb2Q78J03 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Msrb2Q78J03 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Msrb2Q78J03 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Msrb2Q78J03 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Msrb2Q78J03 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Msrb2Q78J03 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Msrb2Q78J03 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Msrb2Q78J03 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Msrb2Q78J03 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Msrb2Q78J03 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Msrb2Q78J03 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Msrb2Q78J03 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Msrb2Q78J03 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Msrb2Q78J03 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Msrb2Q78J03 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Msrb2Q78J03 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Msrb2Q78J03 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Msrb2Q78J03 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Msrb2Q78J03 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Msrb2Q78J03 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Msrb2Q78J03 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Msrb2Q78J03 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Msrb2Q78J03 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Msrb2Q78J03 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Msrb2Q78J03 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Msrb2Q78J03 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Msrb2Q78J03 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Msrb2Q78J03 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Msrb2Q78J03 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Msrb2Q78J03 Gm22937-201ENSMUST00000103954 131 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Msrb2Q78J03 Styxl1-203ENSMUST00000111162 726 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Msrb2Q78J03 Plac8-203ENSMUST00000112910 1224 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Msrb2Q78J03 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Msrb2Q78J03 Gm15625-201ENSMUST00000117617 1093 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Msrb2Q78J03 Gm13039-201ENSMUST00000118638 794 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Msrb2Q78J03 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Msrb2Q78J03 Krtcap2-204ENSMUST00000168900 582 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Msrb2Q78J03 Vmn1r-ps63-201ENSMUST00000174565 989 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Msrb2Q78J03 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Msrb2Q78J03 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Msrb2Q78J03 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Msrb2Q78J03 Gm28901-201ENSMUST00000188810 474 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Msrb2Q78J03 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Msrb2Q78J03 2410002F23Rik-220ENSMUST00000191537 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Msrb2Q78J03 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms