Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp49Q6P9L4 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp49Q6P9L4 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp49Q6P9L4 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp49Q6P9L4 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp49Q6P9L4 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp49Q6P9L4 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp49Q6P9L4 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp49Q6P9L4 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp49Q6P9L4 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp49Q6P9L4 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp49Q6P9L4 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp49Q6P9L4 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp49Q6P9L4 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp49Q6P9L4 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp49Q6P9L4 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp49Q6P9L4 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp49Q6P9L4 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp49Q6P9L4 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp49Q6P9L4 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp49Q6P9L4 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp49Q6P9L4 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp49Q6P9L4 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp49Q6P9L4 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp49Q6P9L4 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp49Q6P9L4 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp49Q6P9L4 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp49Q6P9L4 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp49Q6P9L4 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Usp49Q6P9L4 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp49Q6P9L4 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp49Q6P9L4 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Usp49Q6P9L4 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp49Q6P9L4 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp49Q6P9L4 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp49Q6P9L4 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp49Q6P9L4 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp49Q6P9L4 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Usp49Q6P9L4 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp49Q6P9L4 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp49Q6P9L4 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp49Q6P9L4 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp49Q6P9L4 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp49Q6P9L4 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp49Q6P9L4 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Usp49Q6P9L4 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Usp49Q6P9L4 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp49Q6P9L4 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Usp49Q6P9L4 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp49Q6P9L4 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Usp49Q6P9L4 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp49Q6P9L4 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Usp49Q6P9L4 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Usp49Q6P9L4 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Usp49Q6P9L4 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp49Q6P9L4 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp49Q6P9L4 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp49Q6P9L4 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp49Q6P9L4 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp49Q6P9L4 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp49Q6P9L4 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp49Q6P9L4 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp49Q6P9L4 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp49Q6P9L4 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp49Q6P9L4 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp49Q6P9L4 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp49Q6P9L4 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp49Q6P9L4 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp49Q6P9L4 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp49Q6P9L4 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp49Q6P9L4 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp49Q6P9L4 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp49Q6P9L4 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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