Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Smchd1Q6P5D8 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms