Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
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