Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Olfr1349-207ENSMUST00000216447 2448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nop58Q6DFW4 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms