Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Pkp4Q68FH0 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
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Pkp4Q68FH0 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Pkp4Q68FH0 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Pkp4Q68FH0 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
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