Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Atg9aQ68FE2 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atg9aQ68FE2 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atg9aQ68FE2 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atg9aQ68FE2 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atg9aQ68FE2 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atg9aQ68FE2 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atg9aQ68FE2 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atg9aQ68FE2 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atg9aQ68FE2 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Atg9aQ68FE2 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atg9aQ68FE2 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atg9aQ68FE2 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atg9aQ68FE2 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Atg9aQ68FE2 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Atg9aQ68FE2 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Atg9aQ68FE2 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atg9aQ68FE2 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atg9aQ68FE2 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Atg9aQ68FE2 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Atg9aQ68FE2 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
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