Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW7

Patj, InaD-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PatjQ63ZW7 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Atad3aos-202ENSMUST00000150777 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 2410002F23Rik-220ENSMUST00000191537 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Try5-201ENSMUST00000064324 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Gm15196-201ENSMUST00000121406 482 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Olfr963-201ENSMUST00000073433 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Olfr700-201ENSMUST00000079936 951 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Gm44605-201ENSMUST00000206892 949 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 AC162932.1-201ENSMUST00000219209 872 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PatjQ63ZW7 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms