Protein–RNA interactions for Protein: Q61602

Gli3, Transcriptional activator GLI3, mousemouse

Predictions only

Length 1,583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli3Q61602 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gli3Q61602 Olfr456-201ENSMUST00000057251 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gli3Q61602 Olfr128-201ENSMUST00000080231 1050 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gli3Q61602 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gli3Q61602 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gli3Q61602 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gli3Q61602 Gm12716-201ENSMUST00000120606 1354 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gli3Q61602 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gli3Q61602 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gli3Q61602 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gli3Q61602 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gli3Q61602 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gli3Q61602 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gli3Q61602 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gli3Q61602 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gli3Q61602 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gli3Q61602 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gli3Q61602 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gli3Q61602 Stmn3-201ENSMUST00000103045 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gli3Q61602 Gm21963-201ENSMUST00000179519 330 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gli3Q61602 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gli3Q61602 Gm6378-201ENSMUST00000084199 444 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gli3Q61602 Zfp14-201ENSMUST00000077787 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gli3Q61602 Mtch2-202ENSMUST00000111467 2281 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gli3Q61602 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gli3Q61602 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gli3Q61602 Hsd3b1-202ENSMUST00000107016 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gli3Q61602 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gli3Q61602 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gli3Q61602 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gli3Q61602 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gli3Q61602 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gli3Q61602 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gli3Q61602 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gli3Q61602 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gli3Q61602 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gli3Q61602 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gli3Q61602 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gli3Q61602 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gli3Q61602 Ighv1-12-201ENSMUST00000103500 294 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Gli3Q61602 Gm11191-201ENSMUST00000117231 610 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gli3Q61602 4930594O21Rik-201ENSMUST00000129750 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gli3Q61602 Faap24-203ENSMUST00000154597 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gli3Q61602 Gm20467-201ENSMUST00000172872 994 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Gli3Q61602 Gm30301-201ENSMUST00000199474 652 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Gli3Q61602 AC114645.2-201ENSMUST00000214308 791 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gli3Q61602 AC166061.1-201ENSMUST00000225163 1138 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gli3Q61602 Phf5a-201ENSMUST00000023117 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gli3Q61602 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gli3Q61602 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gli3Q61602 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gli3Q61602 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gli3Q61602 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gli3Q61602 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gli3Q61602 Lgals9-203ENSMUST00000108269 1586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gli3Q61602 Gtf2e2-203ENSMUST00000171010 1664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gli3Q61602 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gli3Q61602 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Gli3Q61602 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gli3Q61602 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gli3Q61602 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gli3Q61602 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gli3Q61602 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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Gli3Q61602 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gli3Q61602 AC151971.6-201ENSMUST00000216193 866 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gli3Q61602 Gm8615-201ENSMUST00000025307 771 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gli3Q61602 Gm8186-201ENSMUST00000053575 386 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gli3Q61602 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gli3Q61602 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gli3Q61602 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gli3Q61602 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gli3Q61602 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gli3Q61602 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gli3Q61602 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gli3Q61602 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gli3Q61602 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gli3Q61602 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gli3Q61602 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gli3Q61602 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gli3Q61602 Rffl-201ENSMUST00000021036 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gli3Q61602 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gli3Q61602 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gli3Q61602 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gli3Q61602 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gli3Q61602 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gli3Q61602 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gli3Q61602 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gli3Q61602 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gli3Q61602 Supt20-ps-201ENSMUST00000117999 1560 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms