Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rbbp7Q60973 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rbbp7Q60973 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rbbp7Q60973 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rbbp7Q60973 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rbbp7Q60973 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rbbp7Q60973 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rbbp7Q60973 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Rbbp7Q60973 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rbbp7Q60973 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rbbp7Q60973 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rbbp7Q60973 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Rbbp7Q60973 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rbbp7Q60973 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rbbp7Q60973 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rbbp7Q60973 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rbbp7Q60973 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rbbp7Q60973 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Rbbp7Q60973 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Rbbp7Q60973 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rbbp7Q60973 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rbbp7Q60973 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rbbp7Q60973 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Rbbp7Q60973 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Rbbp7Q60973 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Rbbp7Q60973 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Rbbp7Q60973 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Rbbp7Q60973 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Rbbp7Q60973 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Rbbp7Q60973 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Rbbp7Q60973 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Rbbp7Q60973 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Rbbp7Q60973 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Rbbp7Q60973 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Rbbp7Q60973 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Rbbp7Q60973 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Rbbp7Q60973 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Rbbp7Q60973 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rbbp7Q60973 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Rbbp7Q60973 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Rbbp7Q60973 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rbbp7Q60973 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rbbp7Q60973 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rbbp7Q60973 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rbbp7Q60973 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rbbp7Q60973 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rbbp7Q60973 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rbbp7Q60973 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rbbp7Q60973 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rbbp7Q60973 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rbbp7Q60973 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rbbp7Q60973 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Rbbp7Q60973 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rbbp7Q60973 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rbbp7Q60973 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rbbp7Q60973 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rbbp7Q60973 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rbbp7Q60973 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbbp7Q60973 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbbp7Q60973 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbbp7Q60973 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbbp7Q60973 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbbp7Q60973 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbbp7Q60973 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbbp7Q60973 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbbp7Q60973 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbbp7Q60973 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbbp7Q60973 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbbp7Q60973 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbbp7Q60973 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbbp7Q60973 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbbp7Q60973 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbbp7Q60973 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbbp7Q60973 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbbp7Q60973 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbbp7Q60973 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbbp7Q60973 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbbp7Q60973 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbbp7Q60973 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbbp7Q60973 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbbp7Q60973 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbbp7Q60973 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbbp7Q60973 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbbp7Q60973 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbbp7Q60973 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbbp7Q60973 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbbp7Q60973 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbbp7Q60973 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbbp7Q60973 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbbp7Q60973 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbbp7Q60973 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbbp7Q60973 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rbbp7Q60973 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rbbp7Q60973 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rbbp7Q60973 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rbbp7Q60973 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Rbbp7Q60973 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rbbp7Q60973 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rbbp7Q60973 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rbbp7Q60973 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms