Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Utp18Q5SSI6 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Utp18Q5SSI6 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Utp18Q5SSI6 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Utp18Q5SSI6 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Utp18Q5SSI6 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Utp18Q5SSI6 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Utp18Q5SSI6 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Utp18Q5SSI6 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Utp18Q5SSI6 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Utp18Q5SSI6 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Utp18Q5SSI6 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Utp18Q5SSI6 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Utp18Q5SSI6 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Utp18Q5SSI6 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Utp18Q5SSI6 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Utp18Q5SSI6 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Utp18Q5SSI6 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Utp18Q5SSI6 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Utp18Q5SSI6 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Utp18Q5SSI6 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Utp18Q5SSI6 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Utp18Q5SSI6 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Utp18Q5SSI6 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Utp18Q5SSI6 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Utp18Q5SSI6 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Utp18Q5SSI6 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Utp18Q5SSI6 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Utp18Q5SSI6 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Utp18Q5SSI6 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Utp18Q5SSI6 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Utp18Q5SSI6 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Utp18Q5SSI6 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Utp18Q5SSI6 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Utp18Q5SSI6 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Utp18Q5SSI6 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Utp18Q5SSI6 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Utp18Q5SSI6 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Utp18Q5SSI6 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Utp18Q5SSI6 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Utp18Q5SSI6 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Utp18Q5SSI6 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Utp18Q5SSI6 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Utp18Q5SSI6 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Utp18Q5SSI6 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Utp18Q5SSI6 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Utp18Q5SSI6 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Utp18Q5SSI6 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Utp18Q5SSI6 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Utp18Q5SSI6 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Utp18Q5SSI6 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Utp18Q5SSI6 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Utp18Q5SSI6 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Utp18Q5SSI6 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Utp18Q5SSI6 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Utp18Q5SSI6 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Utp18Q5SSI6 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Utp18Q5SSI6 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Utp18Q5SSI6 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Utp18Q5SSI6 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Utp18Q5SSI6 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Utp18Q5SSI6 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Utp18Q5SSI6 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Utp18Q5SSI6 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Utp18Q5SSI6 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Utp18Q5SSI6 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Utp18Q5SSI6 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Utp18Q5SSI6 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Utp18Q5SSI6 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Utp18Q5SSI6 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Utp18Q5SSI6 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Utp18Q5SSI6 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Utp18Q5SSI6 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Utp18Q5SSI6 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Utp18Q5SSI6 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Utp18Q5SSI6 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Utp18Q5SSI6 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Utp18Q5SSI6 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Utp18Q5SSI6 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Utp18Q5SSI6 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Utp18Q5SSI6 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Utp18Q5SSI6 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Utp18Q5SSI6 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Utp18Q5SSI6 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Utp18Q5SSI6 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Utp18Q5SSI6 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Utp18Q5SSI6 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Utp18Q5SSI6 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Utp18Q5SSI6 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Utp18Q5SSI6 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Utp18Q5SSI6 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Utp18Q5SSI6 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Utp18Q5SSI6 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Utp18Q5SSI6 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Utp18Q5SSI6 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Utp18Q5SSI6 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Utp18Q5SSI6 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Utp18Q5SSI6 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Utp18Q5SSI6 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Utp18Q5SSI6 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms