Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

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Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim58Q5NCC9 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim58Q5NCC9 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim58Q5NCC9 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim58Q5NCC9 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim58Q5NCC9 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim58Q5NCC9 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim58Q5NCC9 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Trim58Q5NCC9 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim58Q5NCC9 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim58Q5NCC9 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim58Q5NCC9 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim58Q5NCC9 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim58Q5NCC9 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim58Q5NCC9 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Trim58Q5NCC9 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Trim58Q5NCC9 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim58Q5NCC9 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Trim58Q5NCC9 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim58Q5NCC9 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Trim58Q5NCC9 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Trim58Q5NCC9 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Trim58Q5NCC9 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim58Q5NCC9 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim58Q5NCC9 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim58Q5NCC9 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim58Q5NCC9 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim58Q5NCC9 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim58Q5NCC9 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim58Q5NCC9 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim58Q5NCC9 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim58Q5NCC9 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Trim58Q5NCC9 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Trim58Q5NCC9 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Trim58Q5NCC9 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Trim58Q5NCC9 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim58Q5NCC9 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim58Q5NCC9 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Trim58Q5NCC9 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim58Q5NCC9 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim58Q5NCC9 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim58Q5NCC9 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim58Q5NCC9 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim58Q5NCC9 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim58Q5NCC9 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim58Q5NCC9 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim58Q5NCC9 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim58Q5NCC9 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim58Q5NCC9 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim58Q5NCC9 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim58Q5NCC9 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim58Q5NCC9 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim58Q5NCC9 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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