Protein–RNA interactions for Protein: Q3V089

Rbm44, RNA-binding protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 1,013 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm44Q3V089 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbm44Q3V089 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbm44Q3V089 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbm44Q3V089 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbm44Q3V089 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbm44Q3V089 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbm44Q3V089 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbm44Q3V089 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbm44Q3V089 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbm44Q3V089 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbm44Q3V089 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbm44Q3V089 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbm44Q3V089 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbm44Q3V089 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbm44Q3V089 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbm44Q3V089 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbm44Q3V089 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbm44Q3V089 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbm44Q3V089 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbm44Q3V089 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbm44Q3V089 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbm44Q3V089 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbm44Q3V089 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbm44Q3V089 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbm44Q3V089 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbm44Q3V089 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbm44Q3V089 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbm44Q3V089 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbm44Q3V089 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbm44Q3V089 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbm44Q3V089 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbm44Q3V089 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbm44Q3V089 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbm44Q3V089 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbm44Q3V089 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbm44Q3V089 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbm44Q3V089 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbm44Q3V089 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbm44Q3V089 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbm44Q3V089 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbm44Q3V089 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbm44Q3V089 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbm44Q3V089 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbm44Q3V089 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbm44Q3V089 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbm44Q3V089 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbm44Q3V089 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbm44Q3V089 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbm44Q3V089 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbm44Q3V089 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbm44Q3V089 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbm44Q3V089 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbm44Q3V089 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbm44Q3V089 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbm44Q3V089 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbm44Q3V089 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbm44Q3V089 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbm44Q3V089 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbm44Q3V089 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbm44Q3V089 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbm44Q3V089 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbm44Q3V089 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbm44Q3V089 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbm44Q3V089 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbm44Q3V089 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbm44Q3V089 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbm44Q3V089 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbm44Q3V089 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbm44Q3V089 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbm44Q3V089 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbm44Q3V089 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbm44Q3V089 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbm44Q3V089 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbm44Q3V089 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbm44Q3V089 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbm44Q3V089 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbm44Q3V089 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbm44Q3V089 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbm44Q3V089 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbm44Q3V089 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbm44Q3V089 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbm44Q3V089 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbm44Q3V089 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbm44Q3V089 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbm44Q3V089 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbm44Q3V089 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbm44Q3V089 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbm44Q3V089 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbm44Q3V089 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbm44Q3V089 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbm44Q3V089 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbm44Q3V089 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbm44Q3V089 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbm44Q3V089 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbm44Q3V089 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbm44Q3V089 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rbm44Q3V089 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rbm44Q3V089 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rbm44Q3V089 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Rbm44Q3V089 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.3 ms