Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 AC137950.2-202ENSMUST00000227150 1635 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 Bcl2l11-204ENSMUST00000103211 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 Gm23439-201ENSMUST00000104292 132 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 Fam107b-202ENSMUST00000115052 861 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 Gm11993-201ENSMUST00000121861 820 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 Gm26906-201ENSMUST00000180523 1228 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 Gm29642-201ENSMUST00000186170 921 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 2610318N02Rik-202ENSMUST00000207116 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 4933407L21Rik-201ENSMUST00000027426 1146 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 AU016765-201ENSMUST00000097295 946 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 4930579F01Rik-202ENSMUST00000199293 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 Ifna9-201ENSMUST00000102807 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 Trbv31-201ENSMUST00000103300 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 Gm12606-202ENSMUST00000129527 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 Aamdc-206ENSMUST00000136757 789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 Ly6i-202ENSMUST00000166694 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 Gm5335-201ENSMUST00000182995 1000 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 Gm44498-201ENSMUST00000199509 111 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 Gm16305-201ENSMUST00000140747 556 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 Mir6953-201ENSMUST00000184745 68 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 Gm8234-201ENSMUST00000198523 1107 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 E230034D01Rik-203ENSMUST00000217357 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 AC134537.1-201ENSMUST00000219205 265 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 Defb29-201ENSMUST00000060598 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 Ifnl3-201ENSMUST00000078364 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 Prok2-201ENSMUST00000008273 594 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 Gm15984-202ENSMUST00000156466 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm5aQ3UXZ9 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms