Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Dcun1d4-203ENSMUST00000113558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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D13Ertd608eQ3UPR8 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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D13Ertd608eQ3UPR8 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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D13Ertd608eQ3UPR8 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Ddr1-201ENSMUST00000003628 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
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D13Ertd608eQ3UPR8 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
D13Ertd608eQ3UPR8 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
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