Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms