Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Hdgfl2Q3UMU9 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Hdgfl2Q3UMU9 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Hdgfl2Q3UMU9 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Hdgfl2Q3UMU9 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Hdgfl2Q3UMU9 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Hdgfl2Q3UMU9 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
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Hdgfl2Q3UMU9 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hdgfl2Q3UMU9 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hdgfl2Q3UMU9 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hdgfl2Q3UMU9 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hdgfl2Q3UMU9 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Hdgfl2Q3UMU9 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hdgfl2Q3UMU9 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hdgfl2Q3UMU9 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hdgfl2Q3UMU9 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hdgfl2Q3UMU9 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hdgfl2Q3UMU9 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hdgfl2Q3UMU9 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Hdgfl2Q3UMU9 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hdgfl2Q3UMU9 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hdgfl2Q3UMU9 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hdgfl2Q3UMU9 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hdgfl2Q3UMU9 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hdgfl2Q3UMU9 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hdgfl2Q3UMU9 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hdgfl2Q3UMU9 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
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Hdgfl2Q3UMU9 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
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