Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r-ps6-201ENSMUST00000201079 934 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 4930455B14Rik-203ENSMUST00000223613 640 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 AC123738.1-201ENSMUST00000224796 773 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 AC102603.1-201ENSMUST00000227481 584 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Fam186a-201ENSMUST00000062631 759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr248-201ENSMUST00000075329 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Rpl35a-ps7-201ENSMUST00000080603 333 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 AC131120.1-201ENSMUST00000217728 1617 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Ttll1-202ENSMUST00000109479 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtpbp6Q3U6U5 Ms4a7-201ENSMUST00000025574 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtpbp6Q3U6U5 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtpbp6Q3U6U5 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gtpbp6Q3U6U5 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtpbp6Q3U6U5 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11009-201ENSMUST00000108961 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15488-201ENSMUST00000121682 670 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gtpbp6Q3U6U5 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gtpbp6Q3U6U5 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gtpbp6Q3U6U5 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26069-201ENSMUST00000157497 277 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gtpbp6Q3U6U5 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43752-201ENSMUST00000198475 697 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42857-201ENSMUST00000200823 339 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44919-201ENSMUST00000208587 1073 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gtpbp6Q3U6U5 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gtpbp6Q3U6U5 CT009765.2-201ENSMUST00000221331 392 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r42-201ENSMUST00000089419 1098 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gtpbp6Q3U6U5 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gtpbp6Q3U6U5 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtpbp6Q3U6U5 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtpbp6Q3U6U5 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gtpbp6Q3U6U5 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gtpbp6Q3U6U5 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtpbp6Q3U6U5 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gtpbp6Q3U6U5 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43059-201ENSMUST00000202437 1388 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gtpbp6Q3U6U5 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtpbp6Q3U6U5 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtpbp6Q3U6U5 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gtpbp6Q3U6U5 Dcdc2c-204ENSMUST00000189735 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtpbp6Q3U6U5 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gtpbp6Q3U6U5 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gtpbp6Q3U6U5 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtpbp6Q3U6U5 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtpbp6Q3U6U5 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtpbp6Q3U6U5 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gtpbp6Q3U6U5 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtpbp6Q3U6U5 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtpbp6Q3U6U5 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtpbp6Q3U6U5 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtpbp6Q3U6U5 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtpbp6Q3U6U5 Gcg-201ENSMUST00000102733 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtpbp6Q3U6U5 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12598-201ENSMUST00000117333 830 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gtpbp6Q3U6U5 Psph-202ENSMUST00000118268 785 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5742-201ENSMUST00000120764 505 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gtpbp6Q3U6U5 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gtpbp6Q3U6U5 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gtpbp6Q3U6U5 Prr13-202ENSMUST00000164688 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6586-201ENSMUST00000167028 643 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gtpbp6Q3U6U5 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gtpbp6Q3U6U5 Obox6-ps1-201ENSMUST00000176658 1042 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms