Protein–RNA interactions for Protein: Q3U285

Lcorl, Ligand-dependent nuclear receptor corepressor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorlQ3U285 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms