Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Tex29-204ENSMUST00000166638 561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Gm5267-201ENSMUST00000191574 1045 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Gm20735-202ENSMUST00000212387 519 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 AC122860.1-201ENSMUST00000217669 773 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 AC154759.1-201ENSMUST00000224137 1159 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Tnfrsf18-201ENSMUST00000040274 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Ensa-202ENSMUST00000058230 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Prok2-201ENSMUST00000008273 594 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Ptges3l-201ENSMUST00000093933 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Nifk-202ENSMUST00000112688 849 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Tprkb-204ENSMUST00000113752 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Gm15136-201ENSMUST00000120552 533 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Mir6953-201ENSMUST00000184745 68 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 2410002F23Rik-220ENSMUST00000191537 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Gm7192-201ENSMUST00000210793 1137 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Gm5907-202ENSMUST00000210969 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 4930431F10Rik-201ENSMUST00000213122 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Rps2-ps12-201ENSMUST00000214262 785 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Gm7904-201ENSMUST00000217049 465 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 AC170597.1-201ENSMUST00000221956 440 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Cma1-202ENSMUST00000226280 1090 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Cma1-201ENSMUST00000022834 1074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Gm5449-201ENSMUST00000081132 357 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Gm15519-201ENSMUST00000120088 1566 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Gm8050-201ENSMUST00000171987 1595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
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