Protein–RNA interactions for Protein: Q149B8

Perm1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 807 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Perm1Q149B8 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Perm1Q149B8 Gm14055-201ENSMUST00000130262 668 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Perm1Q149B8 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Perm1Q149B8 Gm23675-201ENSMUST00000157311 125 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Perm1Q149B8 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Perm1Q149B8 Gm16538-201ENSMUST00000162407 442 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Perm1Q149B8 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Perm1Q149B8 Gm9162-201ENSMUST00000182081 991 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Perm1Q149B8 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Perm1Q149B8 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Perm1Q149B8 AC124752.1-201ENSMUST00000222131 776 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Perm1Q149B8 CT030652.1-201ENSMUST00000227377 1235 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Perm1Q149B8 Rpl3-201ENSMUST00000081650 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Perm1Q149B8 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Perm1Q149B8 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Perm1Q149B8 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Perm1Q149B8 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Perm1Q149B8 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Perm1Q149B8 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Perm1Q149B8 Uqcrc2-201ENSMUST00000033176 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Perm1Q149B8 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Perm1Q149B8 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Perm1Q149B8 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Perm1Q149B8 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Cidec-203ENSMUST00000113091 785 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Gm37782-201ENSMUST00000194879 678 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Gcg-201ENSMUST00000102733 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Gm16240-201ENSMUST00000161924 614 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Mrto4-ps2-201ENSMUST00000164169 549 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Gm30731-201ENSMUST00000203909 825 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Perm1Q149B8 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms