Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rundc1Q0VDN7 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms