Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Gm13608-201ENSMUST00000121807 1406 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 AC113282.5-201ENSMUST00000224330 1679 ntAPPRIS P1 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Gm4858-201ENSMUST00000179064 735 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 1500015A07Rik-202ENSMUST00000184530 423 ntTSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Mrpl23-207ENSMUST00000210803 590 ntTSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 AC124503.1-201ENSMUST00000218524 526 ntTSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Cxcl10-201ENSMUST00000038816 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Ift43-201ENSMUST00000054565 773 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Rps18-201ENSMUST00000008812 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 0610037L13Rik-206ENSMUST00000120473 835 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Gm14320-201ENSMUST00000137275 1023 ntTSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Gm5808-201ENSMUST00000178090 357 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 n-R5s130-201ENSMUST00000178128 119 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Gm24312-201ENSMUST00000178677 119 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 n-R5s106-201ENSMUST00000179060 119 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 n-R5s118-201ENSMUST00000179887 119 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Gm37723-201ENSMUST00000194480 565 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Fcer2a-205ENSMUST00000208145 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Tpd52l1-204ENSMUST00000214644 1103 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 H2-Aa-201ENSMUST00000040655 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Rps9-201ENSMUST00000006496 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Mir341-201ENSMUST00000093593 96 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Tex45-201ENSMUST00000047265 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Gm6758-201ENSMUST00000119643 1055 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Cd79b-202ENSMUST00000167143 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Gm18124-201ENSMUST00000210695 706 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Mettl18-202ENSMUST00000111490 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Klf3-202ENSMUST00000166409 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Cdip1-202ENSMUST00000117713 1964 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 B430203G13Rik-201ENSMUST00000169657 1375 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Gm20443-201ENSMUST00000173840 735 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Gm44777-203ENSMUST00000206930 571 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms