Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Msx2Q03358 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Msx2Q03358 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Msx2Q03358 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Msx2Q03358 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Msx2Q03358 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Msx2Q03358 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Msx2Q03358 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Msx2Q03358 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Msx2Q03358 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Msx2Q03358 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Msx2Q03358 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Msx2Q03358 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Msx2Q03358 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Msx2Q03358 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Msx2Q03358 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Msx2Q03358 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Msx2Q03358 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Msx2Q03358 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Msx2Q03358 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Msx2Q03358 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Msx2Q03358 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Msx2Q03358 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Msx2Q03358 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Msx2Q03358 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Msx2Q03358 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Msx2Q03358 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Msx2Q03358 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Msx2Q03358 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Msx2Q03358 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Msx2Q03358 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Msx2Q03358 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Msx2Q03358 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Msx2Q03358 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Msx2Q03358 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Msx2Q03358 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Msx2Q03358 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Msx2Q03358 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Msx2Q03358 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Msx2Q03358 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Msx2Q03358 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Msx2Q03358 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Msx2Q03358 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Msx2Q03358 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Msx2Q03358 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Msx2Q03358 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Msx2Q03358 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Msx2Q03358 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Msx2Q03358 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Msx2Q03358 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Msx2Q03358 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Msx2Q03358 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Msx2Q03358 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Msx2Q03358 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Msx2Q03358 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Msx2Q03358 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Msx2Q03358 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Msx2Q03358 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Msx2Q03358 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Msx2Q03358 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Msx2Q03358 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Msx2Q03358 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Msx2Q03358 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Msx2Q03358 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Msx2Q03358 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Msx2Q03358 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Msx2Q03358 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Msx2Q03358 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Msx2Q03358 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Msx2Q03358 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Msx2Q03358 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Msx2Q03358 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Msx2Q03358 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Msx2Q03358 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Msx2Q03358 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Msx2Q03358 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Msx2Q03358 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Msx2Q03358 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Msx2Q03358 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Msx2Q03358 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Msx2Q03358 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Msx2Q03358 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Msx2Q03358 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Msx2Q03358 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Msx2Q03358 Nos3-202ENSMUST00000115090 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Msx2Q03358 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Msx2Q03358 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Msx2Q03358 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Msx2Q03358 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Msx2Q03358 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Msx2Q03358 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Msx2Q03358 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Msx2Q03358 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Msx2Q03358 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Msx2Q03358 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Msx2Q03358 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Msx2Q03358 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.8 ms